La partie commande est l’interface programmable de notre système automatisé; dans cette suite, il sera un robot. Elle traite les informations en provenance des capteurs et envoie les commandes ou les ordres aux actionneurs. De manière générale, cette partie contrôle le fonctionnement de la partie opérative à fin de réaliser les tâches en autonomie totale sous le contrôle d’un opérateur si besoin.
Cette partie peut être constituée d’un simple microcontroleur programmé à l’aide le langage d’assembleur (logiciel de programmation) ou d'une automate programmable ou d'un ordinateur si c'est nécessaire.